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市域内，河网较发育，中小河流众多，长度在５公里以上河流121条，其中流域面积300平方公里以上的河有五龙河、大沽河、大沽夹河、王河、界河、黄水河和辛安河７条。主要河流以绵亘东西的昆嵛山、牙山、艾山、罗山、大泽山所形成的“胶东屋脊”为分水岭，南北分流入海。向南流入黄海的有五龙河、大沽河；向北流入黄海的有大沽夹河和辛安河；流入渤海的有黄水河、界河和王河。其特点，河床比降大，源短流急，暴涨暴落，属季风雨源型河流。其冲积而形成小平原沙土层厚而肥沃，盛产苹果、大樱桃、梨和葡萄。河水清澈见底，两岸林木葱茏，青山绿水，如诗如画。
烟台市北、西北部濒临渤海，东北和南部临黄海。沿海表层水温变化较外海明显且幅较大，年平均水温11～14℃之间。海水表层盐度年平均28～31‰左右。潮汐自莱州到龙口沿海为不正规半日潮，龙口到牟平以及海阳市沿海为正规半日潮。
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